La flore de la Crète est riche et variée. Il y a 130 espèces de fleurs et d’herbes sauvages qui sont uniques en Crète. Parmi elles, il y a le dictamo (organium dictamus). Aristote rendit cette herbe fameuse, grâce à sa valeur médicale. Une autre espèce peu commune est la varietus Cretica qui garde ses feuilles pendant toute l’année.

Le printemps est la meilleure saison pour jouir de la flore de la Crète, grâce à la pluie tombée généreusement en hiver. Les champs sont empourprés par les coquelicots et l’air est embaumé par l’arôme des fleurs d’orangers et des citronniers. Des broussailles sèches prédominent dans le paysage en été, tandis que des lauriers-roses et des fleurs d’osier poussent dans les ravins. En l’hiver, les anémones sont abondantes.

Les plantes les plus rares de Crète poussent dans les ravins ou les pentes raides des montagnes, tels que la Faragi Imbrou (Gorge d’Imbros), près du Refuge de la Mountagne de Kalergis, et de l’Oropedio Spiliou y compris les ebenus Cretica, linum arboreum (lin), campanula pelviformis (clochettes), staechelina arborea et petromarcula arboreum. D’autres plantes fleurissent, dans les plaines et sur les hautes cimes, y compris tulipa bakeri et tulipa saxatilis (tulipes), anchusa caespitosa (orcanette), scabiosa alborincta et scabiosa minoana (scabieuse). Le palmier Crétois (phoenix theophrastii), unique au monde, pousse tout le long de la plage de Vai. D’autres plantes rares, trouvées le long du rivage, sont: pancratium maritime (asphodele), centaurea pumilio (jacée), anthemis tomentell et anthemis filicaulis (camomille).